Национален център по заразни и паразитни болести

НРЛ „Молекулярна микробиология”

НРЛ „Молекулярна микробиология”

Състав на лабораторията:

Зав. лаб. Гл. асистент Стефан Панайотов, д.м. spanaiotov@yahoo.com

Виктория Левтерова д.м., магистър-биолог – vikis@abv.bg
Надя Бранкова, магистър-биолог – nbrankova@abv.bg
Кристин Танкова, медицински лаборант – ktankova@abv.bg
Илка Василева, техническо лице

История на лабораторията

Основана е през 1972 г. от Проф. Д-р Светослав Тодоров дмн, като лаборатория по „Радиационна микробиология” към секция „Молекулярна и клетъчна биология” на института. Дейността й е свързана с изотопен анализ на нуклеинови киселини от микроорганизмен произход; молекулна хибридизация; градиентен анализ и др. От 1992-2000 г. лабораторията е преименувана на „Лаборатория по радиационна микробиология и ДНК технологии” и се ръководи от ст.н.с. II ст. д-р В. Златев дм. Основни насоки в разработките на колектива са: изследване на серовар специфични плазмиди на салмонелни щамове; плазмиден анализ на епидемични дизентерийни щамове; генетика и метаболизъм на коклюшни бактерии. От 2000 г. ръководител на лаборатория „Молекулярна и радиационна микробиология” е Гл. асистент С. Панайотов, д.м. Основни направления в дейността на лабораторията са: рутинна диагностика чрез РСR тест за: хламидиални инфекции (C.trachomatis,), коклюш (B.pertussis), атипични пневмонии придобити в обществото причинени от C.pneumoniae, M.pneumoniae; изследване за легионели (Leg. pneumophila), изследване за Helicobacter pylori, разработване на молекулярно-епидемиологични методи - случайно амплифициране на полиморфни участъци ДНК (RAPD), амплифициране на специфични полиморфни участъци ДНК (AFLP), молекулярна идентификация чрез техниката AFLP и изследване влиянието на стресови фактори чрез транскрипционен анализ. Значителна част от прилаганите в страната съвременни молекулярни методи за диагностика на особено опасни инфекции са разработени в лабораторията.

Изследвания провеждани в лабораторията

Лабораторията като част от структурата на НЦЗПБ е сертифицирана по ISO/IEC 17025 от Българската служба за акредитация да извършва микробиологични изследвания. Ежегодно качеството на диагностичната работа на лабораторията е контролирано и сертифицирано от Европейския Институт по стандартизация и документация на медицинските лаборатории INSTAND, Дюселдорф, Германия. Лабораторията е сертифицирана от INSTAND да извършва молекулярна диагностика на C. trachomatis, B. pertussis, C.pneumoniae, M. pneumoniae; Leg. pneumophila, Helicobacter pylori и Borrelia burgdorferi.

Изследване за полово предавани инфакции - хламидиални инфекции (Chlamydia trachomatis) Хламидиалната инфекция се причинява от вътреклетъчен паразит наречен Chlamydia trachomatis (Хламидия трахоматис). Тя се предава по полов път и засяга както мъже, така и жени. Подходящ материал за мъже е първа сутрешна урина, а за жени – цервикален секрет взет от гинеколог. Лабораторията предлага и комбинирано изследване едновременно за Trichomonas vaginalis, Mycoplasma hominis, Mycoplasma genitalium, Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Ureaplasma urealyticum.
Изследване за коклюш (B.pertussis) Коклюш, още пертусис или магарешка кашлица, е остро инфекциозно заболяване на дихателните пътища, причинено от пръчковидната бактерия Bordetella pertussis. Болестта се предава по въздушно-капков път. Засяга и възрастни, които са основен носител и резервоар на инфекцията, но основно възприемчиви към нея са малките деца и подрастващите. Подходящи материали за изследване са назофарингеален и гърлен секрет
Изследване за атипични пневмонии, придобити в обществото, причинени от Chlamydophila pneumoniae и Mycoplasma pneumoniae Chlamydophila pneumoniae и Mycoplasma pneumoniae – причиняват атипични пневмонии. Счита се, че инфекцията се предава от човек на човек по въздушно-капков път. Най-често се среща между 7 и 40 годишна възраст. Подходящи материали за изследване са храчка или БАЛ (бронхо-алвеоларен лаваж)
Изследване за легионели (Legionella pneumophila) Причинителят на легионелозата се среща навсякъде в околната среда – във вода (термални извори, реки, езера, водоснабдителни системи, охладители), тиня и по-рядко почва. Всяка водна система, която работи в температурен диапазон между 25-50 градуса Сº и може да създаде воден аерозол има потенциал да причини заболяване. Механизмът на предаване е аерогенен и се осъществява при вдишване на легионелни бактерии с аерозоли, образувани от контаминирани водни системи. Подходящи материали за изследване са храчка или БАЛ. Лабораторията предлага и комбинирано изследване едновременно за Chlamydophila pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae, B.pertussis, Legionella pneumophila, Streptococcus pneumoniae и Haemophilus influenzae.
Изследване за Helicobacter pylori Хеликобактер пилори / Hp/ е спирална грам-отрицателна бактерия. Специалистите са установили, че тя съществува в стомаха на около 50% от хората. Голяма част от инфектираните са без симптоми и не подозират проблемите с гастроинтестиналните нарушения - язви, ГЕРБ, стомашен рак. Подходящи материали за изследване -биопсия

ЦЕНИ по наредба №17 на МЗ .....PDF

"Публикации на Национална референтна лаборатория „Молекулярна микробиология”

Списък на публикациите в специализирани научни издания на английски език
1. S. Panaiotov, E. Bachiyska, V. Levterova, N. Brankova, A. Ivanova, D. Merdjanov, Y. Atanasova, T. Kantardjiev. 2010. Limited evidences for spread of Mycobacterium tuberculosis ‘Beijing’ genotype in Bulgaria. Problems Infect. Parasit. Dis. 38:1:7-9
2. I. Ivanov, R. Nenova, S. Panaiotov, M. Tiholova, K. Marinov. T. Kantardjiev. 2010. Clinical management of travel-associated brucellosis cases in Bulgaria. Problems Infect. Parasit. Dis. 38:1:15-18
3. S. Panaiotov, M. Amicosante. 2010. Dynamics of the laboratory results in patients with pulmonary tuberculosis. Diagnostic Microbiology & Infectious Disease 67: 327-332 DOI : 10.1016/j.diagmicrobio.2010.03.002
4. Valcheva V, Mokrousov I, Panaiotov S, Bachiiska E, Zozio T, Sola C, Markova N, Rastogi N. 2010. Bulgarian specificity and controversial phylogeography of Mycobacterium tuberculosis spoligotype ST125_BGR. FEMS Immunology & Medical Microbiology, 59 (1): 90 - 99, DOI: 10.1111/j.1574-695X.2010.00667.x
5. Victoria Levterova, Stefan Panaiotov, Nadia Brankova, Kristin Tankova. 2010. Typing of Genetic Markers Involved in Stress Response by Fluorescent cDNA-Amplified Fragment Length Polymorphism Technique. Molecular Biotechnology. DOI: 10.1007/s12033-009-9236-y
6. Panaiotov S, Ciccozzi M, Brankova N, Levterova V, Mitova-Tiholova M, Amicosante M, Rezza G, Kantardjiev T. 2009. An outbreak of Q fever in Bulgaria. Ann Ist Super Sanita. 45(1):83-6.
7. Boyanova L., Markovska R., Yordanov D., Marina M., Ivanova K., Panayotov S., Gergova G., Mitov I. 2009. High prevalence of virulent Helicobacter pylori strains in symptomatic Bulgarian patients. Diagn Microbiol Infect Dis. 64(4):374-80.
8. S. Panaiotov, Y. Evstatieva, S. Ilieva, V. Levterova, N. Brankova, D. Nikolova, A. Ivanova, V. Stefanova, K. Tankova and A. Atev. 2009. Quantitative assessment of the dominant genome in fusant cultures. Biotechnol. Biotechnol Eq. 892-895
9. Stefan Panaiotov. 2009. Cristalline nitrate reductase reagent for drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis. Int. J. Antimirob. Agents. 34(2):191-2
10. Sabtcheva, S., Kantardjiev, T., Georgieva, E., Panaiotov, S., Kaku, M. Plasmid-mediated PER-1 extended-spectrum betalactamase in Providencia retgeri from Bulgaria. 2008. Problems Infect. Parasitic Dis. 36(2):29-30
11. Martin A, Panaiotov S, Portaels F, Hoffner S, Palomino JC, Angeby K. 2008. The nitrate reductase assay for the rapid detection of isoniazid and rifampicin resistance in Mycobacterium tuberculosis: a systematic review and meta-analysis. J. Antimicrob. Chemother. 62:56-64
12. T. Kantardjiev, V. Levterova, S. Panaiotov, I. Ivanov, E. Hristozova. 2006. Molecular taxonomy of Cryptococcus neoformans varieties displaying phenotypic similarities. Biotechnol. & Biotechnol. Eq., vol.2 p.101-103
13. T. Kantardjiev, V. Levterova, N. Brankova, I. Ivanov, P. Angelov, S. Panaiotov. 2006. Role of fluorescent amplified fragment length polymorphism analysis in taxonomy, identification and epidemiological examinations of yeast pathogens. Biotechnol. & Biotechnol. Eq., 1:103-106
14. Kremer K, Arnold C, Cataldi A, Gutierrez MC, Haas WH, Panaiotov S, Skuce RA, Supply P, van der Zanden AG, van Soolingen D. 2005 Discriminatory power and reproducibility of novel DNA typing methods for Mycobacterium tuberculosis complex strains. J Clin Microbiol. 43(11):5628-38.
15. Ivanov I., N. Brankova, S. Panaiotov, V. Levterova, T. Kantardjiev. 2005. Internal posistive control for PCR diagnosis of Bordetella pertussis: Design and laboratory evaluation. Problems Infec. Parasit. Dis. 2:30-33
16. S. Panaiotov, V. Levterova, I. Ivanov, N. Brankova, T. Kantardjiev, N. Vladimirova, V. Voinova, E. Kazarova. 2005. Pertussis in the Bulgarian population: role of PCR diagnosis. Problems Infec. Parasit. Dis. 2:38-40
17. S. Panaiotov, T. Kantardjiev, V. Levterova, R. Lazarova, I. Kadiev, E. Savov. 2004. Evaluation of PCR strategies for laboratory diagnosis of mycobacterial infections. Problems of Infec. Parasit. Dis.32:2, 31-35
18. T. Kantardjiev, V. Levterova, S. Panaiotov, I. Ivanov. 2004. Use of Amplified fragment length polymorphism analysis as a tool for identification and typing of yeast isolates. Mikol. Lek. 11:2, 113-117
19. N. Tsvetkova, M. Schild, S. Panaiotov, R. Kurdova, B. Gottstein, J. Walochnik, H. Aspock, M. S. Lucas and N. Muller. 2004. The identification of free-living environmental isolates of amoebae from Bulgaria. Parasitology Res. 92:405-413
20. T. Kantardjiev, V. Levterova, S. Panaiotov, I. Ivanov. 2004. Development of AFLP and RAPD Methods for Typing of Clinically Significant Candida Species. Problems of Infec. Parasit. Dis. 32:1, 35-37
21. V. Lefterova, T. Kandtardjiev, S. Panaiotov, I. Ivanov, A. Kouzmanov. 2003. RAPD Typing of Isolates from Patients with Chronical Recurrent Vaginal Candidosis. Problems of Infec. Parasit. Dis. 31:2, 23-26
22. Stefan Panaiotov, Velio Velev, Toma Kostov, Todor Kantardjiev, Victoria Levterova . 2003. 79-Year Old Man with Wrist-Joint Tuberculosis – Case Report. Problems of Infec. Parasit. Dis. 31:2, 22-23
23. S. Panaiotov, T. Kantardjiev. 2003. Association of nitrate reductase activity of M. tuberculosis for drug susceptibility. Problems of Infec. Parasit. Dis. 31:2, 20-22
24. E. Georgieva, S. Panaiotov, V. Levterova, T. Kantardjiev, 2003. PCR detection of Chlamydia trachomatis in genitourinary specimens. Probl. Infec. Parasit. Dis. 31:1 p.12-14
25. V.Stavrakieva, T. Kantardjiev, S. Panaiotov, V. Levterova. 2003. PCR as a method for diagnosis of Scopulariopsis brevicauslis. Problems of Infec. Parasit. Dis. Vol. 31:1 p.14-15
26. Stefan Panaiotov, Todor Kantardjiev. 2002. Nitrate Reductase Assay for Drug Susceptibility Testing of Mycobacterium tuberculosis J. Clin. Microbiol. 40: 3881-3882.
27. V.Stavrakieva, T. Kantardjiev, S. Panaiotov, V. Levterova. 2002. PCR method for evaluation of Scopulariopsis brevicaulis infection of nails. Problems of Infec. Parasit. Dis. 30:1, 23-25
28. Christova, I. L. Schouls, I. Pol, J. Park, S. Panaiotov, V. Lefterova, T. Kantardjiev, J. Dumler. 2001. High prevalence of Granulocytic Ehrlichiae and Borrelia burgdorferi Sensu lato in Ixodes ricinus Ticks from Bulgaria. J. Clin. Microbiol. 39:4172-4174
Списък на публикациите в специализирани научни издания и сборници на български език
29. Н. Бранкова, В. Левтерова, С. Панайотов, Т. Кантарджиев. 2011. Коклюш - съвременно състояние на проблема. Педиатрия, LI:1, 65-67
30. С. Панайотов, Г. Иванова, Е. Бачийска 2009. Молекулярни методи за генотипиране на Mycobacterium tuberculosis. Съвременна медицина. 60, 5-6:140-147
31. Л. Боянова, Вл. Панов, Д. Йорданов, Р. Марковска, М. Марина, Г. Гергова, К. Иванова, Ст. Панайотов, Н. Бранкова, В. Левтерова, И. Митов, Т. Кантарджиев, З. Кръстев, 2008. Helicobacter pylori в устната кухина – предварителни проучвани. Българска Хепатогастроентерология, бр.1, стр. 3-10
32. Н. Бранкова, С. Панайотов, В. Левтерова, Е. Добрева, Т. Кантарджиев. 2007. Молекулярна диагностика на причинители на атипични пневмонии – Coxiella burnetii, Legionella pneumophila, Chlamydophila pneumoniae и Mycoplasma pneumonieae. Съвременна медицина, 3:15-21
33. Т. Кантарджиев, П. Ангелов, В. Левтерова, С. Панайотов, Н. Бранкова. 2007. Молекулярни методи заепидемиологично типизиране на патогенни гъбички. Инфектология, Изънреден брой, стр. 29-32
34. И. Иванов, Т. Кантарджиев, П. Падешки, Р. Ненова, С. Панайотов, В. Левтерова. 2007. Мултилокусен анализ на тандемни ДНК повтори за генотипизиране на Francisella tularensisи приложението му при клинични материали. Инфектология, Изънреден брой, стр. 66-68
35. С. Панайотов, В. Левтерова, Н. Бранкова, К. Танкова, Т. Кантарджиев. 2007. Организация на вътрешния и външен лабораторен контрол на молекулярно-биологичните изследвания. Инфектология, Изънреден брой, стр. 88-92
36. С. Панайотов, В. Левтерова, Н. Бранкова, Р. Томан, Т. Кантарджиев. 2007. Разработване на градиентен PCR метод за едновеременно диагностициране на причинители на коклюш и атипични пневмонии. Съвременни методи в молекулярната диагностика. Инфектология, Изънреден брой, стр. 103-106
37. С. Панайотов, Р. Томан. 2007. Съвременни аналитични техники в геномиката и протеомиката – кръгова амплификация и лигиране в близост. Инфектология, Изънреден брой, стр. 98-101
38. Н. Бранкова, С. Панайотов, В. Левтерова, И. Иванов, Е. Георгиева, Т. Кантарджиев. 2007. ПВР за диагностика на причинители на коклюш и атипични пневмонии. МедикАрт. 1: 8-12
39. Т. Кантарджиев, Н. Бранкова, Е. Добрева, С. Панайотов, В. Левтерова. 2006. Съвременна диагностика на атипични пневмонии придобити в обществото, причинени до Chlamydophila pneumoniae и Mycoplasma pneumoniae. Мед. Преглед, 42. 2:58-60
40. Н. Бранкова, С. Панайотов, В. Левтерова, Т. Кантарджиев. 2006. Скринингово проучване на асимптоматични пациенти с инфекция с C. trachomatis в София. Акуш. Гинек. 2:25-28
41. С. Панайотов. 2005. Приложение на генотипирането за превенция и контрол на туберкулозата. Информ. Журнал НЦЗПБ, бр.6: 9-19
42. T. Кантарджиев, Н. Бранкова, И. Иванов, С. Панайотов, В. Левтерова. 2005. Актуални проучвания за разпространението на коклюша в България и молекулярно-генетичната му диагностика. Педиатрия, 4:31-33
43. С. Панайотов, Д. Пейчев, В. Левтерова, Т. Кантарджиев, И. Иванов. 2004. PCR метод за лабораторна диагностика на Bordetella pertussis. Инфектология. –16:4, 22-25
44. Е. Георгиева, С. Панайотов, В. Левтерова, Т. Кантарджиев. 2003. PCR метод за етиологична диагноза на полово предавана хламидиаза. Инфектология. – 40:4, 19-21
45. С. Панайотов. 2003.Генофондът – система за глобален информационен обмен. 10-ти конгрес по микробиология. Сборник доклади, София. Том 2, стр.308-310.
46. Т. Кантарджиев, Б. Попов, С. Панайотов, и колектив от отдел „Микробиология” на НЦЗПБ-София. 2003. Микробиологична диагностика на Bacillus anthracis – класически и молекулярно-биологични методи. 10-ти конгрес по микробиология. Сборник доклади, София. Том 2, стр.42-44.
47. В. Левтерова, С. Панайотов, Т. Кантарджиев, И. Иванов, Е. Георгиева, В. Ставракиева, А. Кузманов. 2003. Анализ на методите AFLP, RAPD, и място-специфична PCR амплификация за типиране на Candida albicans. 10-ти конгрес по микробиология. Сборник доклади, София. Том 2, стр.30-34.
48. Т. Кантарджиев, С. Панайотов, В. Левтерова, И. Иванов, Б. Попов, Ц. Велинов. 2003. Етиологична диагностика и генетични методи за епидемиологично маркиране на Francisella tularensis. 10-ти конгрес по микробиология. Сборник доклади, София. Том 2, стр.39-41.
49. В. Левтерова, Т. Кантарджиев, С. Панайотов, И. Иванов, В. Ставракиева, Е. Георгиева. 2003. AFLP техниката като нов подход за генетична идентификация на микроорганизми. 10-ти конгрес по микробиология. Сборник доклади, София. Том 2, стр.10-13.
50. Т. Кантарджиев, Р. Вачева, С. Панайотов, А. Бачварова, Ц. Велинов, В. Левтерова. 2002. Сравнително проучване на полимеразно верижна реакция и конвенционални микробиологични методи за доказване на метицилин-резистентни стафилококи сред клинични изолати. Инфектология, 39:4, 16-19
51. Кантарджиев, Т. Г. Асева, В. Богатинов, А. Бачварова, С. Панайотов, В. Левтерова, П. Петров и др. 2002. Новости в микробилогичната диагностика на важни заболянаия. Инфектология, 38:1, 21-29
52. И. Христова, С. Панайотов, В. Левтерова, Е. Тасева, Т. Кантарджиев. 2001. Доказване чрез PCR на коинфекция с B. burgdorferi и причинителя на човешката ерлихиоза в кърлежи. Инфектология 38:2.
Глави от монографии на английски език
1. S. Panaiotov, M. Amicosante, N. Brankova, M. Ciccozzi, M. Ciotti, M. Equestre, V. Levterova, T. Kantardjiev, G. Pisani. 2010. Guidelines and quality control in molecular biology diagnostics. ISBN 978-954-92298-2-0
2. Stefan Panaiotov, Massimo Amicosante, Marc Govaerts, Elizabeta Bachiyska, Nadia Brankova, Victoria Levterova. 2011. Diagnostic and Molecular Epidemiology Methods of Mycobacteria. In: BSL3 and BSL 4 Agents. Eds.: Elschner, Cutler, Weidmann, Butaye. В печат от WILEY-VCH Verlag GmbH
Патенти
1. С. Панайотов, Т. Кантарджиев. 2003. Метод за определяне на лекарствената устойчивост на микроорганизми от род Микобактериум. Рег. №. 108 464/2003,
Предложения за внедрявания:
1. М. Николова, А. Михова, Д. Станкулова, С. Панайотов, В. Левтерова. 2009. Въвеждане на нов SSP-PCR метод за определяне на HLA-B*5701 алел при ХИВ+ пациенти. Инф. Журнал на НЦЗПБ бр.3/2009